基于m7G相关长链非编码RNA的肺腺癌预后风险模型构建及免疫特征分析

《European Journal of Medical Research》:Prognostic risk model of six m7 g-related lncRNAs in lung adenocarcinoma

【字体: 时间:2025年06月11日 来源:European Journal of Medical Research 2.8

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  本研究针对肺腺癌(LUAD)预后预测的临床难题,通过TCGA数据库挖掘与N7-甲基鸟苷(m7G)修饰相关的长链非编码RNA(lncRNA)标志物。研究人员采用LASSO回归构建了包含6个m7G相关lncRNA的预后模型,验证其预测效能(AUC=0.737),发现低风险组具有更佳免疫浸润特征。该研究为LUAD个体化治疗提供了新型分子标志物和免疫治疗响应预测工具。

  

肺腺癌(LUAD)作为肺癌最常见的亚型,其五年生存率长期徘徊在20%以下,传统病理分期系统难以解释患者间的预后差异。这种临床困境背后,是肿瘤异质性和微环境调控机制的复杂性。近年来,RNA表观遗传修饰尤其是N7-甲基鸟苷(m7G)在肿瘤中的作用逐渐被揭示,但其相关长链非编码RNA(lncRNA)在LUAD中的预后价值仍是未解之谜。

为解决这一科学问题,遵义医科大学附属医院的研究团队在《European Journal of Medical Research》发表了创新性研究成果。研究通过整合生物信息学与临床验证,首次构建了基于m7G相关lncRNA的LUAD预后预测体系。该工作不仅发现了6个关键lncRNA标志物,更揭示了其与肿瘤免疫微环境的密切联系,为精准医疗提供了新视角。

研究采用TCGA-LUAD队列的412例样本,通过Pearson相关性分析筛选m7G相关lncRNA,结合LASSO回归构建预后模型。关键技术包括:1) CIBERSORT算法分析22种免疫细胞浸润;2) 基因集富集分析(GSEA)解析通路特征;3) 独立临床队列(28对样本)的RT-qPCR验证;4) 免疫检查点分子差异分析。

结果

Construction of prognosis model with six m7G-related lncRNAs
通过LASSO回归筛选出6个关键lncRNA:保护性因子RP11-83A24.2、RP11-363N22.3、RP11-15H20.6、CTD-2017D11.1和风险因子AC007128.1、HNRNPUP1。风险评分公式整合各lncRNA表达水平与回归系数,如AC007128.1系数为+0.339提示其促癌作用。

Accuracy validation of the prognostic model
模型在训练集和验证集的AUC分别达0.737和0.735。热图显示风险lncRNA在高低风险组表达差异显著,生存分析证实高风险组预后更差(HR=1.73, p=0.001)。

Independent validation and nomogram construction
多因素Cox证明模型是独立预后因素(p=0.012)。列线图整合临床分期与lncRNA特征,1年生存预测C-index>0.6,校准曲线显示优异的一致性。

Analysis of immune infiltration
低风险组富含静息肥大细胞(p<0.05)和CD28、CTLA4等免疫检查点分子,而高风险组以活化树突细胞和嗜酸性粒细胞为特征。FUT4在高风险组高表达提示潜在PD-L1耐药。

Differential gene and pathway analysis
GSEA揭示高风险组富集E2F靶点、MYC信号等促癌通路,低风险组激活干扰素α反应和p53通路。

临床标本验证
28对标本RT-qPCR证实:4个保护性lncRNA在癌组织低表达且与分化程度负相关(rs
=-0.516~-0.536),而HNRNPUP1在肿瘤中高表达。

这项研究开创性地建立了m7G相关lncRNA的LUAD预后预测体系,其价值体现在三方面:1) 6-lncRNA特征可作为传统病理分期的补充指标;2) 免疫特征分析为免疫治疗响应预测提供新依据;3) FUT4等耐药相关分子的发现提示联合治疗策略。特别值得注意的是,保护性lncRNA与肿瘤分化程度的强相关性(rs
<-0.4),为理解表观遗传调控肿瘤恶性转化提供了新线索。未来研究可深入探索m7G-lncRNA如何通过E2F/MYC等通路影响肿瘤微环境,推动个体化治疗的发展。

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