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广西地区蓝翅鸫指名亚种(Myophonus caeruleus caeruleus)线粒体全基因组测序及系统发育分析
《Russian Journal of Genetics》:Complete Mitochondrial Genome of Myophonus caeruleus caeruleus (Passeriformes: Muscicapidae) in Guangxi, China
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月11日 来源:Russian Journal of Genetics 0.6
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来自广西的研究人员对蓝翅鸫指名亚种(Myophonus caeruleus caeruleus)进行线粒体全基因组测序,采用Illumina Novaseq平台获得16?819 bp完整序列,包含13个蛋白质编码基因(PCGs)、22个tRNA基因、2个rRNA基因(12S rRNA和16S rRNA)及控制区(CR)。研究发现该亚种与云南个体聚为一支,并与白尾蓝地鸫(Enicurus schistaceus)亲缘关系最近,为鸫科鸟类系统发育和群体遗传学研究提供重要分子数据。
科研人员成功解析了广西地区蓝翅鸫指名亚种(Myophonus caeruleus caeruleus)的完整线粒体基因组。这个16?
819 bp的环状DNA分子包含13个能量代谢相关的蛋白质编码基因(PCGs)、22个转运RNA(tRNA)基因、核糖体RNA基因(12S rRNA和16S rRNA)以及调控复制的控制区(CR)。碱基组成分析显示,鸟嘌呤(G)含量最低(14.93%),而胞嘧啶(C)含量最高(31.03%),这种偏倚性在鸟类线粒体中颇为典型。
通过构建系统发育树发现,广西的指名亚种与云南的蓝翅鸫个体形成单系群,两者共同与白尾蓝地鸫(Enicurus schistaceus)构成姐妹群关系。这些线粒体数据就像分子"条形码",不仅揭示了鸫科鸟类的演化历史,还为后续研究种群迁徙、遗传多样性等科学问题提供了基础数据。特别值得注意的是,控制区(CR)作为线粒体基因组中变异最丰富的区域,将成为未来种群遗传研究的重点靶标。
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